En el Ministerio del Trabajo, más exactamente en la Dirección Territorial de Bogotá, se adelantan 46 procesos de investigación contra los operadores de Transmilenio y del Sistema Integrado de Transporte de la capital del país, ante las quejas de incumplimiento de normas laborales desde el año 2014.

Según el Ministerio, en el 2016 se incrementaron las quejas de los trabajadores ante la entidad: en 2016 se registraron 27 quejas por incumplimientos laborales de la empresa, mientras que en 2015 fueron 26 y en 2014 fueron 12.

Las quejas más frecuentes son violación a la jornada máxima legal, la violación a normas de salud y seguridad en el trabajo, el no pago de dominicales y festivos y la no cancelación de prestaciones sociales.

Las empresas con mayor cantidad de quejas por parte de los trabajadores son la empresa de transporte integrado de Bogotá SAS-empresa de transporte del tercer milenio Transmilemio SA, Express del futuro, entre otros, según el mintrabajo.